【喵呜刷题小喵解析】:工程进度计划系统的构成内容中,由不同功能进度计划组成的有业主方的控制性进度计划、项目部的实施性进度计划。选项A中的施工总进度计划、主体工程施工进度计划、钢结构工程施工计划,属于同一功能进度计划,即施工进度计划。选项B中的设计进度计划、物资采购进度计划、施工管理机构的操作性进度计划,同样属于同一功能进度计划,即项目管理的计划。选项D中的企业的年度进度计划、项目部的月度进度计划,虽然涉及不同的时间跨度,但仍然属于同一功能进度计划,即施工或项目的进度计划。选项C中的业主方的控制性进度计划、项目部的实施性进度计划,属于不同功能进度计划。业主方的控制性进度计划是项目整体的控制性计划,而项目部的实施性进度计划是具体施工或操作的计划,两者在功能和目的上有所不同。选项E中的企业投标的指导性进度计划、项目部的实施性进度计划,同样属于不同功能进度计划。企业投标的指导性进度计划是为了满足投标需求而制定的,而项目部的实施性进度计划是为了具体施工或操作而制定的,两者在目的和细节上有所不同。因此,正确答案为选项C和E。