【喵呜刷题小喵解析】根据《公路工程设计变更管理办法》,重大设计变更是指对项目的规模、标准、总体布局、设计方案、重大工程措施、重要工程数量等方面发生变化的变更。选项A中的“连续长度2km以下的路线方案调整”并未涉及重大变化,因此不是重大设计变更。选项B中的“特大桥的结构形式发生变化”明显属于重大变化,因此是重大设计变更。选项C中的“隧道施工方案发生变化”并未明确说明变化程度,因此不能确定是否为重大设计变更。选项D中的“工程费用超过施工图设计批准预算的”虽然涉及费用变化,但并未明确说明变化是否重大,因此不能确定是否为重大设计变更。因此,正确答案为B。