产品认证申请时，申请人应当保证在其质量体系中明确规定对认证机构应负的责任，可指定一个人员，此人要独立于()，并具有资格与认证机构保持联系。

在产品认证申请过程中，申请人需要保证其质量体系中明确规定了对认证机构应负的责任。为了与认证机构保持联系，可以指定一个人员，该人员需要独立于管理者代表，并具备相应的资格。因此，答案为D，即“管理者代表”。