关于收入确认的表述，下列哪项是正确的？

本题考查收入确认的相关知识点。
A项中，现金折扣是先按总价法全额确认销售收入，现金折扣实际发生时计入财务费用，因此甲公司6月1日应确认收入20000元，与题目中的说法不符。
B项中，商业折扣是应按照扣除商业折扣后的金额确定销售收入，题目中的做法错误。
C项中，销售折让在发生时冲减当期的销售商品收入，因此甲公司应冲减9月份收入2000元，与题目描述一致。
D项中，如果销售折让发生在资产负债表日后，应按照资产负债表日后事项的相关规定进行处理，题目中的处理方式不正确。
综上所述，答案为C。