对于不涉及政府资金投资、但关系国家安全、生产力重大布局、战略性资源开发和重大公共利益的项目，其管理实行的是哪种制度？

对于不使用政府资金投资建设的项目，关系国家安全、涉及生产力重大布局、战略性资源开发和重大公共利益的，实行核准制。其余非政府投资项目则实行备案制。因此，选项B“核准制”是正确答案。