【喵呜刷题小喵解析】:根据题目描述,建立健康档案的主体应该是与基层卫生服务直接相关的机构。乡镇卫村卫生室和社区卫生服务中心都是基层卫生服务的提供者,而三级医院、二级医院和健康管理中心通常提供的是更高级别的医疗服务。因此,建立健康档案的主体最有可能是乡镇卫村卫生室和社区卫生服务中心,其中社区卫生服务中心是更常见的基层卫生服务机构。因此,答案为D,即“社区卫生服务中心”。