【喵呜刷题小喵解析】:达尔文在《物种起源》中阐述的主要内容是进化论。进化论是达尔文在《物种起源》中提出的核心理论,他主张物种是通过自然选择不断演化和适应环境的过程,而不是固定不变的。因此,选项C“进化论”是正确答案。其他选项如A项基因理论、B项条件反射、D项细胞学说,都不是达尔文在《物种起源》中阐述的主要内容。