【喵呜刷题小喵解析】:达尔文在《物种起源》中阐述的主要内容是进化论。进化论是达尔文在《物种起源》中提出的核心理论,主张物种是逐渐演化而来的,而不是神创的。基因理论、条件反射和细胞学说虽然都是生物学的重要概念,但它们并不是《物种起源》中达尔文阐述的主要内容。因此,正确答案为C。