【喵呜刷题小喵解析】:在生产澄清果汁工艺中,果胶酶的主要作用是分解果胶,从而改善果汁的澄清度。果胶是植物细胞壁的主要成分之一,它能使果汁变得浑浊。加入果胶酶后,果胶被分解为较小的分子,使得果汁变得更为澄清。因此,果胶酶的主要作用是改善果汁的澄清度,从而提高果汁的出汁率。选项A提高果汁中氨基酸含量、选项B抑制微生物的生长、选项C改善果汁的风味都不是果胶酶在澄清果汁工艺中的主要作用。因此,正确答案为D。