【喵呜刷题小喵解析】:在认证机构的组织结构中,为了确保管理层和其他认证人员及各委员会的任务、责任、权利和相互关系得到明确,需要将其形成文件。文件是记录、传达和保存信息的一种常见方式,因此,认证机构应将其组织结构形成文件。规则、程序和规章虽然都是组织运行的重要依据,但在此题中,文件是更为合适的选择。因此,答案为D。