【喵呜刷题小喵解析】根据《建筑工程施工许可管理办法》的规定,对于未取得施工许可证擅自施工的行为,可以对建设单位和施工企业同时处以罚款。因此,选项C“可以同时对建设单位和施工企业处以罚款”是正确的。而选项A“只能责令停止施工,限期改正”和选项B“可以对在建工程采取查封措施”均不是该办法规定的法律责任,选项D“应当依法追究刑事责任”也过于严厉,因为该办法并未规定需要追究刑事责任。因此,正确答案为C。