【喵呜刷题小喵解析】:根据《国家重大技术改造项目管理办法》的规定,国务院经济贸易主管部门负责对国家重大技术改造项目实施监督检查。因此,正确答案为“国务院经济贸易主管部门”,即选项B。其他选项如国务院发展计划部门、国家发改委和国务院水利部门均不是负责监督检查国家重大技术改造项目的部门。