【喵呜刷题小喵解析】施工企业以一笔款项购入三项没有单独标价的固定资产后,在确定各项固定资产的成本时,应按照各项固定资产的公允价值比例对总成本进行分配。这是因为固定资产的公允价值能够反映其市场价值,是最接近实际成本的计量方式。因此,选项D“公允价值比例”是正确答案。