【喵呜刷题小喵解析】:根据水利水电工程施工质量检验有关规定,见证取样资料应由施工单位制备。这是因为施工单位是实际进行取样和检测的单位,他们具备专业的技术人员和设备,能够按照规定的程序和要求进行取样和检测,并制备相应的见证取样资料。其他选项如质量监督部门、项目法人和监理单位虽然也可能参与取样和检测的过程,但他们不是制备见证取样资料的主体单位。因此,正确答案是D,即施工单位。