【喵呜刷题小喵解析】:水运工程招投标中,资格预审的审查方法主要包括合格制和有限数量制。合格制是指只要满足资格预审文件中的最低要求,申请人即可通过资格预审;有限数量制则是指通过评分或评审的方式,筛选出符合一定数量要求的申请人通过资格预审。因此,选项A“合格制”和选项B“有限数量制”是正确的。选项C“推荐制”、选项D“淘汰制”和选项E“邀请制”并不属于资格预审的审查方法,所以不应被选择。