【喵呜刷题小喵解析】:《中华人民共和国水上水下活动通航安全管理规定》中明确指出,国家海事管理机构主管全国水上水下活动通航安全监督管理工作。因此,在内河通航水域进行水上水下活动,通航安全监督管理工作的负责单位是国家海事管理机构,选项C正确。国务院交通运输主管部门、各地安全监督部门、各地港务监督均不是负责单位,因此选项A、B、D错误。