【喵呜刷题小喵解析】:《标准施工招标文件》中明确指出,监理人向承包人发出暂停施工指令时,承包人应按照监理人的要求停止施工,并妥善保护已完工程以及已运至施工场地的材料、设备,且应对停工期间的工程以及材料、设备提供安全保障。因此,暂停施工期间负责保护工程并提供安全保障的主体为承包人。所以,正确答案为B。