【喵呜刷题小喵解析】:根据题目描述,项目管理机构设立了合约部、工程部和物资部等部门,其中物资部下设采购组和保管组。合约部、工程部均可对采购组下达工作指令。这种组织结构模式下,部门之间存在交叉管理和指令下达,导致采购组需要同时接受合约部和工程部的指导,形成了职能式组织结构的特点。因此,答案为C,即职能组织结构。