【喵呜刷题小喵解析】:《水利水电工程标准施工招标文件》(2009年版)规定了施工招标文件的基本构成,其中包括协议书、图纸和已标价工程量清单。然而,选项D“投标人要求澄清招标文件的函”并不属于合同文件的组成部分。因此,正确答案为D。