【喵呜刷题小喵解析】:根据《中华人民共和国矿产资源法》的规定,矿产资源勘查的审批和采矿许可证的颁发,由国务院地质矿产主管部门或者省、自治区、直辖市人民政府地质矿产主管部门审批和颁发。对于深海矿产资源开发,由于涉及到海洋资源的特殊性,其采矿许可证的审批和颁发应当遵循更严格的程序和标准。因此,深海矿产资源开发的采矿许可证,应由国务院地质矿产主管部门审批和颁发。因此,选项D是正确答案。