【喵呜刷题小喵解析】根据题目描述,由于一段时间内停产或其他原因,暂停许可的决策应该由认证机构和被许可方双方共同商定。因此,选项C“认证机构和被许可方双方商定”是正确的答案。选项A“认证机构自行决定”和选项B“被许可方提出申请”都不符合题目描述,选项D“以上都不正确”显然也是错误的。因此,正确答案是C。