产品认证工厂检查时，()负责编制工厂检查报告。

在产品认证工厂检查过程中，检查组长负责编制工厂检查报告。这是因为检查组长不仅要监督整个检查过程，确保其符合认证要求和标准，而且还要汇总检查结果，编制详细的检查报告，以便于后续的评估和分析。因此，正确答案是B。