根据《最高人民法院关于审理期货纠纷案件若干问题的规定》，以下情形应当认定为透支交易的有（）。

根据《最高人民法院关于审理期货纠纷案件若干问题的规定》第三十一条，期货交易所在期货公司没有保证金或者保证金不足的情况下，允许期货公司继续持仓或开仓交易应当认定为透支交易。同样，期货公司在客户没有保证金或者保证金不足交易所标准的情况下，允许客户开仓交易也属于透支交易。因此，选项A、B和D均正确。而选项C中的情形，期货公司允许客户在保证金不足自定标准但高于交易所标准的情况下继续持仓，并不符合规定的透支交易情形，所以C错误。