关于金融机构协助查询存款通知书签发机构的问题，下列哪些机构签发的协助查询存款通知书需要由县级（含）以上机构出具？

办理协助查询业务时，金融机构经办人员需要核实执法人员的工作证件，以及有权机关县级（含）以上机构签发的协助查询存款通知书。因此，本题正确答案为C。