商业银行某信用管理等级公司客户获得3年期贷款后，预计第一年、第二年、第三年出现违约的概率分别为0.4%、1.2%、3.6%，则第三年末该信用等级的公司客户归还全部本息的概率为（）。

根据题目描述，商业银行某信用管理等级公司客户获得3年期贷款后，预计第一年、第二年、第三年出现违约的概率分别为0.4%、1.2%、3.6%。要计算第三年末该信用等级的公司客户归还全部本息的概率，需要计算连续三年的信用状况良好的概率。具体来说，第一年不违约的概率是（1-0.4%），第二年不违约的概率是（1-1.2%），第三年不违约的概率是（1-3.6%）。因此，第三年末该信用等级的公司客户归还全部本息的概率为（1-0.4%）×（1-1.2%）×（1-3.6%），计算结果为94.86%，因此答案为D。