商业银行在计算资本充足率时，应当从二级资本中全额扣除商誉、其他无形资产等项目，因为当银行遇到金融危机时，这些被扣除的项目很难真正用于抵御风险。

根据商业银行资本充足率的计算规则，商誉和其他无形资产等项目在计算资本充足率时确实应当从二级资本中全额扣除。因为这些项目在银行面临金融危机时，其实际价值可能会大幅度下降，难以真正用于抵御风险。因此，这个陈述是正确的。