在银行办理银团贷款业务过程中，发现借款人存在哪些违约行为需由代理行负责召开银团会议并追究其违约责任？

根据参照解析，银行在办理银团贷款业务过程中发现借款人存在以下违约行为，需要由代理行负责召开银团会议并追究其违约责任：所提供的有关文件被证实无效、未能履行和遵守贷款协议所约定的义务、未能按贷款协议规定支付利息和本金以及以假破产等方式逃废银行债务。这些行为对应了选项A、B、C和D。选项E“擅自提前收回贷款或违约退出银团”并未在参照解析中提及作为需要召开银团会议并追究违约责任的违约行为。