项目的盈利能力分析确实包括内部收益率(D)、净现值(E)、投资回收期(A)和投资利润率(B)等指标。这些指标都是用来评估项目盈利能力的常用指标。而存货周转率(C)主要用于分析企业的营运能力,不属于盈利能力分析的指标。因此,正确答案包括A、B、D、E。