根据题目描述,甲公司经营证券经纪业务、证券资产管理业务和证券承销与保荐业务,符合应当建立独立董事制度的条件。其他公司只经营单一或不足两种业务,不需要建立独立董事制度。因此,应当建立独立董事制度的是甲公司。