在证券公司与客户进行金融交易并通过银行账户划转资金时，按照《金融机构大额交易和可疑交易报告管理办法》规定，应由哪一机构提交大额交易报告？

在证券公司与客户进行金融交易并通过银行账户划转款项的情况下，根据《金融机构大额交易和可疑交易报告管理办法》的规定，提交大额交易报告的责任由银行机构承担。因此，正确答案为C。