申请公司债券上市交易，应当向（）报送上市报告书、公司章程等相关文件。

申请公司债券上市交易，应当向证券交易所报送上市报告书、公司章程等相关文件。这是根据现行的证券法和相关交易所的规定得出的结论。其他选项如国务院证券监督管理机构、工商行政管理局和发改委并不是直接报送上市报告书的机构。因此，正确答案为B。