负责客户信用资金存管的（）应当按照客户信用资金存管协议的约定，对证券公司违反规定的资金划拨指令予以拒绝。

根据题干所述，负责客户信用资金存管的商业银行应当按照客户信用资金存管协议的约定，对证券公司违反规定的资金划拨指令予以拒绝。因此，正确答案为B。