关于A公司固定资产的处理，下列说法正确的是哪项？

A项，增值税一般纳税人，固定资产发生的进项税额允许抵扣，不计入固定资产成本，因此购买固定资产时发生的增值税额不应计入入账价值，所以A项错误。

C项，日常修理费用应费用化直接计入当期损益，一般计入管理费用。因此，固定资产日常修理费用不可以资本化，C项错误。

D项，应扣除被替换部分账面价值。因此，当固定资产发生大修理支出时，应予以资本化的支出应该是实际支出扣除被替换部分账面价值的差额，而非仅仅是50万元。所以D项错误。

只有B选项正确，即固定资产折旧方法折旧由直线法改为年数总和法为会计估计变更。