哪些机构需要缴纳企业所得税？

根据《中华人民共和国企业所得税法》第一条的规定，除了个人独资企业和合伙企业不适用企业所得税法以外，凡是在中国境内的企业和其他取得收入的组织都是企业所得税的纳税人，需要依法缴纳企业所得税。因此，有限责任公司和股份有限公司都需要缴纳企业所得税，而个人独资企业和合伙企业则缴纳个人所得税。对于合伙企业，如果合伙人是自然人，则需要缴纳个人所得税；如果合伙人是法人或其他组织，则需要缴纳企业所得税。因此，正确答案为A、D。