关于上市公司治理结构中的专门委员会和董事会秘书的职责，下列哪些选项是正确的？

根据《上市公司治理准则》，上市公司董事会应当设立审计委员会，专门委员会的提案应当提交董事会审议决定。审计委员会中独立董事应当占多数并担任召集人。独立董事不得在上市公司兼任除董事会专门委员会委员外的其他职务。同时，上市公司设董事会秘书，负责公司股东大会和董事会会议的筹备及文件保管、公司股东资料的管理等事宜。因此，关于上市公司治理结构中的专门委员会和董事会秘书的职责，正确的选项是ACD。