在编制资产负债表时，下列哪些项目需要根据有关科目的期末余额进行填列？

在编制资产负债表时，需要根据有关科目的期末余额进行填列的项目包括：“长期股权投资”、“其他应收款”和“存货”。

对于“长期股权投资”，根据其科目期末借方余额减去相关减值准备后的金额填列。
对于“其他应收款”，需要根据“其他应收款”和“其他应付款”科目所属明细科目期末借方余额之和，再减去相关坏账准备后的金额填列。
对于“存货”，需要依据多个相关科目（如物资采购、原材料等）的期末借方余额之和，减去存货跌价准备后的金额填列。

而“预付账款”项目并非直接根据期末余额填列，而是根据“应付账款”和“预付账款”两个总账科目的明细科目期末借方余额之和填列。因此，“预付账款”并不包括在需要根据有关科目的期末余额进行填列的项目中。

因此，正确答案是A、C、E。