1988年巴塞尔协议通过的《关于统一国际银行的资本计算和资本标准的报告》规定，自2011年初按照3%的标准引入的是()监管指标。

根据题目中的描述，巴塞尔委员会决定引入基于规模、与具体资产风险无关的杠杆率监管指标，作为资本充足率的补充。自2011年初开始按照3%的标准监控杠杆率的变化。因此，正确答案是D，即杠杆率。题目中提到的其他选项如总资产充足率、反周期超额资本和一级资产充足率，均与题干描述不符。