存款经营的影响因素主要包括支付机制的创新、存款创造的调控和政府的监管措施。因此,选项A、B和D是正确的。而选项C“贷款客户的选择”和选项E“经营理念的变化”并不是存款经营的主要影响因素,所以C和E不是正确答案。