上市公司运作员工持股计划的资金来源主要包括: 从福利费中拨付; 工资基金结余拨付; 员工工资扣除; 以员工持股机构未来将拥有的股票作为质押向银行申请贷款(即质押贷款)。因此,选项A、B、C和D都是正确的。选项E“国家拨款”不是员工持股计划的资金来源之一,故排除。