关于一般纳税人自来水公司销售自来水的增值税征收问题，按照简易办法应依照多少征收率进行征收，并且不得抵扣其购进自来水的增值税扣税凭证上注明的税款？

本题考查增值税的征收率。对属于一般纳税人的自来水公司销售自来水按简易办法依照3%征收率征收增值税，不得抵扣其购进自来水取得增值税扣税凭证上注明的增值税税款。因此，正确答案为B。