关于工程变更的处理流程，下列哪一选项描述正确？

关于工程变更的处理流程，描述正确的是：总监理工程师组织专业监理工程师对工程变更费用及工期影响作出评估。这一选项与参考答案相符。其他选项的解析如下：

A选项：总监理工程师组织监理员审查施工单位提出的工程变更申请，提出审查意见。这一描述不完整且不准确，因为审查工程变更申请的不只是监理员，还包括专业监理工程师。

B选项：对涉及工程设计文件修改的工程变更，应由监理单位转交原设计单位修改工程设计文件。这一描述不准确，实际上应该是由建设单位转交原设计单位进行修改。

C选项：必要时，项目监理机构应组织设计、施工等单位召开论证工程设计文件的修改方案的专题会议。这一描述缺少“建议建设单位”的表述，完整的描述应该是项目监理机构应建议建设单位组织相关单位召开专题会议。

综上所述，D选项描述正确。