重大科技专项中的集成电路布图设计登记主要包括以下内容: 申请前期分析:对集成电路布图设计进行前期评估和分析,确定是否符合登记要求。 保密审查:对集成电路布图设计进行保密性审查,确保技术秘密不被泄露。 初审:对申请进行初步审查,核实布图设计的真实性和合法性。 登记并公告:完成审查后,对符合条件的集成电路布图设计进行登记,并公告于世。 集成电路布图设计专有权的归属管理:这确实是国家重大科技专项中的集成电路布图设计管理的主要内容,涉及到布图设计专有权的归属和权益保护等问题。 所以,选项A、B、C、D和E都是正确的。