税务机关采取税收保全措施的方法主要包括哪些？

税务机关采取税收保全措施的方法主要包括两种：一是书面通知纳税人开户银行或其他金融机构冻结纳税人的金额相当于应纳税款的存款，二是查封、扣押纳税人价值相当于应纳税款的商品、货物和其他财产。选项A和C是正确的。而选项E是冻结存款的一种表现形式，也属于税收保全措施之一。选项B描述的扣缴税款是在纳税人未按时缴纳税款时采取的措施，不属于税收保全措施。选项D中的拍卖所得扣缴税款是在税收强制执行措施中的步骤，也不属于税收保全措施。因此，正确答案为A、C、E。