产品质量监督部门依法对某企业生产的产品进行抽查，发现其产品质量不合格，质量监督部门应对该企业做出的处理为（ ）。

根据《产品质量法》的规定，对于监督抽查发现的产品质量不合格的企业，应由实施监督抽查的产品质量监督部门责令其限期改正。因此，正确的处理方式是责令该企业限期改正，选项A是正确答案。其他选项如吊销税务登记证、责令停业、吊销营业执照等不是针对产品质量不合格企业的直接处理方式。