甲公司在2×20年年初实施的短期利润分享计划中，设定了全年净利润目标为5000万元。若实际净利润超过此目标，管理层可分享超出部分的10%作为额外报酬。至2×20年末，公司实际全年净利润达到6000万元。在不考虑其他因素的情况下，应计入管理费用的额外金额是（ ）万元。

根据题目中的信息，甲公司的短期利润分享计划规定，公司管理层可以分享超过5000万元净利润部分的10%作为额外报酬。甲公司2×20年全年实际完成净利润6000万元，因此超过5000万元的部分是1000万元。按照计划规定，这10%应作为管理层的额外报酬，即应计入管理费用的金额为100万元。因此，答案为B。