甲公司2020年利润总额为1000万元，实际发生税收罚款支出50万元，会计折旧与税法差异导致少计提折旧100万元。年初递延所得税负债余额为50万元，年末固定资产账面价值与计税基础有差异。除此外，没有其他纳税调整事项。甲公司税率为25%，请计算其2020年净利润。

甲公司2020年的净利润计算过程如下：
1. 计算当期所得税：根据题目，甲公司2020年利润总额为1000万元，实际发生税收罚款支出50万元，由于会计采用的折旧方法与税法规定不同，当期会计比税法规定少计提折旧100万元。因此，当期应纳税所得额=1000+50-100=950万元。所以，当期所得税=950万元×25%=237.5万元。
2. 计算递延所得税费用：年末固定资产账面价值为5000万元，其计税基础为4700万元，产生的递延所得税负债为(5000-4700)×25%=75万元。由于年初递延所得税负债为50万元，因此，递延所得税费用=75万元-50万元=25万元。
3. 计算所得税费用总额：所得税费用总额=当期所得税+递延所得税费用=237.5万元+25万元=262.5万元。
4. 计算净利润：净利润=利润总额-所得税费用总额=1000万元-262.5万元=737.5万元。
所以，甲公司2020年的净利润为737.5万元，答案为D。