甲公司以固定资产和无形资产作为对价获取集团内乙公司100%股权，固定资产和无形资产账面价值分别为700万元和400万元，公允价值分别为800万元和500万元。合并日乙公司所有者权益账面价值为1300万元，相对于最终控制方而言的价值为1400万元，且集团原合并乙公司时产生商誉200万元。在确认对乙公司的长期股权投资时，甲公司应确认的资本公积为多少？

根据题目信息，甲公司以一项固定资产和一项无形资产作为对价取得同一集团内乙公司100％的股权。在合并日，乙公司所有者权益账面价值为1300万元，相对于最终控制方而言的账面价值为1400万元。长江集团原合并乙公司时产生商誉200万元。因此，长期股权投资的初始投资成本 = 1400万元 + 200万元商誉 = 1600万元。甲公司应确认的资本公积为初始投资成本减去固定资产和无形资产的账面价值，即1600万元 - (700万元 + 400万元) = 500万元（贷方）。因此，答案为D。