关于甲所欠合伙企业债务与其债权之间的抵销问题，下列哪一选项是正确的？

甲与该合伙企业之间的债权债务可以进行抵销，但甲不得以其对乙的债权去抵销甲欠合伙企业的债务。因此，甲只能将其所欠合伙企业5万元货款与该合伙企业所欠其3万元到期借款进行抵销，仍需向该合伙企业偿付2万元。选项B正确，而选项A、C、D均错误。