根据题目描述,甲产品的生产决策需要考虑其边际贡献。甲产品的边际贡献是指其销售收入与变动成本之间的差额。如果甲产品停产后会使企业利润增加,那么应该继续生产,因为其边际贡献可以抵减固定成本。在本题中,甲产品停产后会使企业利润减少40000元,因此不应停产。因此,正确答案是C。