关于审计中应付账款的实质性程序，下列哪些选项是正确的？

关于审计中应付账款的实质性程序，选项A“从供应商发票追查至应付账款明细账”，选项C“检查资产负债表日后应付账款明细账贷方发生额的相应凭证，确定入账时间是否合理”和选项D“函证余额较小、甚至为零但交易频繁的供应商”都是正确的实质性程序。而与应付账款存在认定相关的程序应该是从应付账款明细账追查至相关的原始凭证，如订购单、验收单等，所以选项B不恰当。完整性认定相关的实质性程序的目标是确保所有应当记录的交易都被记录，因此选项A、C和D都是与应付账款完整性认定相关的实质性程序。